Situato vicino alla Plaza Mayor di Madrid, inizialmente era un mercato all'aperto, dedicato alla vendita del pesce. Viene citato nel giugno 1835 dal Giornale di Madrid, diretto da Mesonero Romanos, in riferimento alla possibile costruzione di diversi mercati. I lavori per trasformarlo in mercato coperto, diretti dall'architetto Alfonso Dubé y Díez, iniziarono nel 1913 e si conclusero tre anni dopo, nel 1916. Furono utilizzate le tecniche più avanzate dell'epoca per garantire la solidità della struttura e anche la salubrità e coibentazione degli interni: travi in ghisa come sostegno e travetti dello stesso materiale per assemblare il tetto, dotato anche di persiane per garantire un costante ricircolo dell'aria, tramezzi per separare le platee, pedana con vani di areazione e un piano interrato destinato per magazzino. La seconda grande trasformazione del mercato è arrivata con il XXI secolo. Dichiarato Bene di Interesse Culturale nel dicembre 2000 e dopo sei anni di lavori, il nuovo Mercato di San Miguel ha riaperto le sue porte al pubblico nel 2009, diventando un mercato all'avanguardia, pieno di utenti e turisti desiderosi non solo di condividere la miriade di prodotti offerti, ma contemplare uno spazio storico ascoltando gli echi delle bancarelle del passato in un'opera d'arte pronta ad attraversare con passo deciso questo nuovo secolo.