O Museu Naval é uma entidade cultural estatal, localizada no primeiro andar do Quartel-General da Marinha, no Paseo del Prado (Madri), e gerido pelo Ministério da Defesa através da Direção Geral de Relações Institucionais de Defesa: Subdireção Geral do Patrimônio Histórico-Artístico; e dependência orgânica do almirante-chefe do Estado-Maior General da Marinha, regido por um Real Conselho Curador ao qual se aplicam as disposições do Real Decreto 620/1987, de 10 de abril, que aprova o Regulamento dos Museus Estatais.

O Museu tem como missão adquirir, conservar, pesquisar, comunicar e expor, para fins de estudo, educação e contemplação, peças, conjuntos e coleções de valor histórico, artístico, científico e técnico relacionadas com a atividade naval, com o objetivo de divulgar a história marítima da Espanha, contribuir para ilustrar, realçar e salvaguardar as suas tradições e promover a consciência marítima nacional.