Das Museum wird zur Erfüllung all seiner künstlerischen und kulturellen Funktionen von der Fundación Colección Thyssen-Bornemisza FSP verwaltet, einer gemeinnützigen öffentlichen Stiftung, deren Zweck die Erhaltung, Erforschung, öffentliche Ausstellung und Verbreitung der Sammlung ist.

Der spanische Staat erwarb 1993 das Eigentum an der Sammlung, wodurch das sogenannte Dreieck der Kunst im Paseo del Prado entstand, ein Museumsbereich in Madrid, der das wichtigste Bilderbe Spaniens und eines der wichtigsten der Welt konzentriert Welt. Seit 2004 stellt die Stiftung auch Leihgaben aus der Privatsammlung von Baroness Carmen Thyssen-Bornemisza aus.

Ständige Abholzeiten: Montag: von 12:00 bis 16:00 Uhr. Dienstag bis Sonntag: von 10:00 bis 19:00 Uhr (freie Öffnung).